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历史批次报告：2026-09-19 新规则复查已将这六题标为需修订；原数值检查仍有效。查看更新
化学 × 1–10 nm
从结构材料到六道可复算候选
6 道候选，6 道通过数值复核，0 道正式可用题。这批题属于公开开发示例，后续不作为保密测试题。合并后全站共有 32 条候选，其中 14 条数值实例、18 条草案。31 个任务规划方向仍单独统计。
来源与实际覆盖
筛选了 5 项来源资源（并非 5 篇独立论文），最终采用 SAMPL9 官方挑战的 BCD、DMBCD 和 WP6 三个主体构象。它们属于两个相关来源家族，复用的是结构材料，本轮题目是新构建的几何测量题，并非复制原有结合自由能题或答案。
| 主体 | 完整输入原子数 | 输入长度 | 题目编号 |
|---|
| BCD | 147 | 1.444 nm | CNM001–002 |
| DMBCD | 189 | 1.626 nm | CNM003–004 |
| WP6 | 150 | 1.827 nm | CNM005–006 |
输入长度定义为完整主体的最大重原子中心距；推理长度取题目指定原子子集的最大中心距。XYZ 输入保留全部原子。这是本批工作定义，不是范德华直径、空腔直径或溶液中的尺寸。只覆盖约 1.44–1.83 nm，不代表覆盖了整个 1–10 nm 区间。
按题目查看 M0–M6 实际输入输出 ↗
模块实际做了什么
- M0 范围配置：化学、输入 1–10 nm、目标 5–10 道候选，允许不达数量。
- M1 材料整理：助手检索官方来源，下载并记录版本与校验值；逐个主体将 PDB 转为 XYZ，保留原子顺序和坐标。检索和转换尚不是通用自动任务。
- M2 证据提取：记录官方结构来源、坐标和 Å 单位依据。单位原文首次因空格差异未通过匹配，按原文保留后重检通过。
- M3 任务模板：采用指定原子对距离、指定三原子夹角两种基础感知模板。三项结合推断提案因缺少客体、复合物或验证条件而未纳入。
- M4 构题与计算：题目明确原子行号、单位、构象和精度；数值答案由程序计算。
- M5 质量筛查：逐项比较 PDB 与 XYZ 坐标、顺序；再用另一读取方法与另一计算公式复算六个答案。此复核不等同于领域专家审核。
- M6 导出：模型输入与内部答案分别导出。本次进一步将六题发布为明确标记的开发示例，并在网站保留待审核状态。
检查结果与剩余缺口
距离采用 Decimal 平方根复核，角度采用 atan2 复核，与 Builder 原计算的最大差异小于 10⁻⁹。作答容差为距离 0.001 Å、角度 0.1°；容差检查储存坐标的计算结果，不表示实验精度。
所有题均为 Perception，仅有两个模板。距离题直接提供原子对，不要求模型搜索最远原子对。尚未进行独立人工审核、模型难度测试或科学发现价值验证。下一轮优先扩展 M3/M4 的构象比较、结合姿态等任务及对应评分器。
可追溯来源与许可
SAMPL9 官方数据 · 固定版本；数据署名 SAMPL9 challenge contributors。BCD 类主体由 Gilson group 提供，WP6 主体由 Isaacs group 提供，具体说明见原仓库各 host_files README。采用其 CC BY 4.0 非软件材料许可：许可全文。本项目进行了 PDB→XYZ 格式转换并构建新题。
wwPDB 坐标格式和 Å 单位依据。各题详情中提供对应固定版本 PDB 链接、完整 XYZ、参考答案与评分容差。全文材料、内部运行快照和本地路径未上传。